More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1563 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  91.87 
 
 		 369 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 369 aa  752    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  60.06 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  44.04 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  35.08 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.52 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  35.34 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  31.83 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 		 658 aa  150  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.65 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.84 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  35.63 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.91 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.84 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 623 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  32.22 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  33.74 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 467 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  31.98 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  27.9 
 
 		 600 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  30.71 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.17 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  30.35 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  30.35 
 
 		 356 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.62 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  32.46 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.08 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 620 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  29.04 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.08 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.89 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 471 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  31.84 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  33.03 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.37 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.73 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  31.06 
 
 		 685 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  31.61 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30.57 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 339 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  28.79 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  31.86 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  28.28 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>