More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6091 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
387 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  58.81 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  48.82 
 
 
342 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  46.45 
 
 
685 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  58.3 
 
 
320 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  45.71 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  47.48 
 
 
536 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  42.72 
 
 
456 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  41.96 
 
 
372 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  38.55 
 
 
390 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  37.95 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 
401 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  40.19 
 
 
413 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  41.06 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 
376 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
415 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
415 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
415 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
415 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 
401 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  35.82 
 
 
417 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
393 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
415 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  34.23 
 
 
396 aa  183  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.01 
 
 
368 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  41.93 
 
 
368 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 
434 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 
382 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.04 
 
 
397 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  30.98 
 
 
409 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 
588 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
351 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 
364 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 
485 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 
345 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 
358 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  32.29 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  32.3 
 
 
493 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.24 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 
337 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.65 
 
 
356 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 
356 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 
362 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.41 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 
344 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.65 
 
 
356 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.65 
 
 
351 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.41 
 
 
356 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.65 
 
 
356 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
344 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.36 
 
 
356 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.38 
 
 
370 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 
338 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 
341 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  33.77 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  31.11 
 
 
422 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 
587 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 
326 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  29.01 
 
 
345 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 
314 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  30.82 
 
 
360 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.9 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  31.88 
 
 
623 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  33.22 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.41 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 
425 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  29.04 
 
 
415 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  32.25 
 
 
353 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.54 
 
 
333 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 
422 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 
337 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  29.81 
 
 
364 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 
372 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 
407 aa  122  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 
658 aa  123  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 
362 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  32.36 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  28.87 
 
 
406 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 
336 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>