More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2026 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  97 
 
 		 333 aa  651    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  38.96 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  40.52 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  38.22 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  40.32 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  41.43 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  37.41 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.56 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  37.86 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.21 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  34.73 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.86 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.92 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  35.92 
 
 		 356 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  35.92 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  35.92 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  42.74 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  40.7 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.32 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  32.32 
 
 		 418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 407 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 412 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.15 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.29 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.29 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.14 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.88 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  35.89 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  31.78 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  31.75 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  33.88 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 440 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  31.87 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  30.59 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 620 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  27.38 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  31.95 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  29.85 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  30.09 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  27.13 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.01 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 464 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  30.64 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 362 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  26.88 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  29.59 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 623 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.48 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  27.66 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  28.12 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.98 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  31.49 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>