More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1821 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  85.09 
 
 		 401 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 401 aa  816    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  50.58 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  37.65 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  40.39 
 
 		 342 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  38.4 
 
 		 401 aa  185  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  33.26 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  35.74 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  35.81 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  33.57 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  33.76 
 
 		 685 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 468 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  32.55 
 
 		 493 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  33.61 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  35.98 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.66 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  31.71 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  31.32 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 587 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  31.03 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.22 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.01 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  25.8 
 
 		 658 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  32.25 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  26.38 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  26.4 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  27.37 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  29.11 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.21 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.52 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  27.73 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  27.98 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.61 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.06 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.31 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  27.95 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 		 623 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.67 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  28.69 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  27.76 
 
 		 360 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  27.04 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  28.13 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.68 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  28.31 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  27.56 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 		 372 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.48 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 		 357 aa  94  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 322 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 		 314 aa  93.2  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  28.43 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  27.84 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  26.91 
 
 		 600 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  23.88 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 331 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  27.64 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  26.65 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>