282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2380 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 691 aa  1373    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  83.18 
 
 		 409 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  42.57 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  27.59 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 393 aa  107  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  26.67 
 
 		 685 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 385 aa  101  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 342 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  30.31 
 
 		 397 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 376 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  29.47 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 		 397 aa  94.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 413 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  29.78 
 
 		 396 aa  94  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  29.08 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 401 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  30.17 
 
 		 395 aa  91.3  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 395 aa  90.5  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.1 
 
 		 468 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  26.7 
 
 		 422 aa  87.8  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 658 aa  87.4  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  28.72 
 
 		 368 aa  87  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 401 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  24.4 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  26.48 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  26.35 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  24.58 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.87 
 
 		 356 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  23.87 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  25.2 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.54 
 
 		 356 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  26.25 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  26.25 
 
 		 370 aa  83.2  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.87 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  23.61 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  24.11 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  25.75 
 
 		 415 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  25.75 
 
 		 415 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  25.35 
 
 		 355 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  25.75 
 
 		 415 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  27.74 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 409 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  25.56 
 
 		 362 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  25.61 
 
 		 493 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  24.04 
 
 		 351 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  26.22 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  26.15 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  28.15 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  24.42 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  27.46 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  26.16 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 		 338 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  27.15 
 
 		 440 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  27.4 
 
 		 387 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  25.99 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  24.93 
 
 		 623 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  26.82 
 
 		 358 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  23.84 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  23.76 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  26.23 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.06 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  26.25 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  24.93 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.12 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  25.36 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  24.8 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  24.86 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  22.11 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  33.16 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  25.77 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  24.57 
 
 		 379 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  25.27 
 
 		 357 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  23.92 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  26.92 
 
 		 352 aa  67  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  24.85 
 
 		 333 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  28.72 
 
 		 388 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  26.42 
 
 		 336 aa  67  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  23.46 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  26.2 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  25.56 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  24.75 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  24.48 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  24.06 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  26.84 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  22.7 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  26.79 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  26.09 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  23.71 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  24.46 
 
 		 351 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>