More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2055 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 407 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  42.57 
 
 		 691 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  45.68 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  29.33 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 342 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  32.99 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  30.13 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  27.38 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  28.09 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  29.11 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  27.11 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  29.32 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  29.61 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 536 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.79 
 
 		 451 aa  96.7  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  25.2 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  27.11 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  25.31 
 
 		 338 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  25.2 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  25.2 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  23.69 
 
 		 337 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  26.02 
 
 		 493 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  26.12 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  26.12 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.4 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  26.2 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.12 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.12 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  27.78 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  26.9 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  26.12 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  25.37 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  25.84 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  25.84 
 
 		 356 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.61 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  26.61 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  26.35 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  25.66 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  22.22 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  25.21 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  23.46 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  26.26 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  25.67 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  25.93 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  24.92 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  27.83 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  28.12 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  26.73 
 
 		 620 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  24.73 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  25.23 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  26.09 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  25.96 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  22.32 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  22.03 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  24.19 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  25.24 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  22.11 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  26.58 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  19.94 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  24.54 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  26.58 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  26.58 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  23.51 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  24.25 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  25.29 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  26.42 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  37.19 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  27.16 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  24.03 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  22.75 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  27.65 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  26.79 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  27.04 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  26.22 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 546 aa  67  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  26.89 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  25.66 
 
 		 347 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>