More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2395 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 415 aa  850    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 415 aa  850    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 415 aa  850    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  76.87 
 
 		 415 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  73.98 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  64.41 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  61.61 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  43.9 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 409 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  49.11 
 
 		 587 aa  276  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  40.61 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  39.15 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 342 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.85 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  32.46 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.71 
 
 		 685 aa  156  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  32.65 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 456 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  33.43 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.83 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.7 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.04 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.38 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  28.06 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  31.31 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  27.37 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  25.71 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  38.15 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  25.13 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  24.62 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  26.17 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.12 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.68 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  25.62 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  24.05 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  26.79 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  25.89 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  26.5 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 282 aa  99.8  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  27.08 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  26.9 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  38.86 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  23.38 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  25.28 
 
 		 600 aa  96.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.89 
 
 		 344 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  24.74 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  33.14 
 
 		 314 aa  94.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  23.96 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  24.57 
 
 		 330 aa  93.2  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  25.23 
 
 		 339 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  24.27 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  26.44 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  24.46 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  26.14 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  24.69 
 
 		 658 aa  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  26.15 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.87 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  25.19 
 
 		 691 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  31.03 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  35.06 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  25.69 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  26.65 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 327 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  27.13 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  26.22 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.61 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>