More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1089 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  639    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  79.94 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  59.87 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.33 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  53.62 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  55.33 
 
 		 346 aa  340  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  53.44 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  54.42 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  49.82 
 
 		 282 aa  296  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  45.15 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  40.57 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 391 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 		 399 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.13 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  34.45 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.13 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.89 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  26.86 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  37.08 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.32 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.36 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 467 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 467 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  34.57 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  32.51 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 415 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 464 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.08 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  31.43 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.48 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  34.21 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  36.53 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 352 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  29.93 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  29.93 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.49 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  28.91 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.85 
 
 		 599 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.12 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  34.27 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  31.43 
 
 		 368 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  33.75 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 		 456 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.11 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  31.28 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  33.7 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  31.01 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  35.92 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  35.88 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  31.96 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>