More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0927 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  677    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  59.87 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  64.94 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  58.47 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  54.18 
 
 		 362 aa  355  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  52.87 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  53.97 
 
 		 346 aa  344  8.999999999999999e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  56.55 
 
 		 300 aa  342  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  54.61 
 
 		 282 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  48.37 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.99 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  30.56 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  25.67 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  37.21 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  36.27 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  40.34 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 579 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 471 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  29.94 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 599 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 464 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  34.57 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.08 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.87 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  31.4 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  36.22 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  37.71 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.66 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 536 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  30.91 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.52 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 403 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  28.9 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  26.35 
 
 		 467 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  26.35 
 
 		 467 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 418 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.59 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  33.04 
 
 		 412 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  33.04 
 
 		 438 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  33.53 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  26.59 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  31.64 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  29.22 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  28.7 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.16 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  32.81 
 
 		 454 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 393 aa  99  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  27.67 
 
 		 442 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 456 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  34.76 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  33.5 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  32.66 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.83 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.57 
 
 		 345 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  25.97 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>