More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3761 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
415 aa  840    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  82.89 
 
 
415 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  73.98 
 
 
415 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  73.98 
 
 
415 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  73.98 
 
 
415 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  63.88 
 
 
417 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  57.91 
 
 
371 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  46.01 
 
 
418 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 
409 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  42.05 
 
 
434 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  47.63 
 
 
587 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  39.21 
 
 
493 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  35.21 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 
342 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.45 
 
 
385 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
536 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 
407 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.01 
 
 
401 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 
395 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  32.1 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 
401 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.44 
 
 
685 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  30.23 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  30.7 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 
456 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  32.22 
 
 
376 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.54 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 
468 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 
588 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  38 
 
 
320 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  27.84 
 
 
393 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  28.24 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  30.68 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  25.61 
 
 
333 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  25.07 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 
349 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.59 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.02 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  27.51 
 
 
422 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  27.44 
 
 
355 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  24.38 
 
 
338 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  26.8 
 
 
370 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  25.59 
 
 
363 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 
335 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.17 
 
 
388 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  27.99 
 
 
331 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.64 
 
 
357 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  26.17 
 
 
337 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 
344 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  26.87 
 
 
335 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  24.33 
 
 
341 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  24.53 
 
 
345 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  31.76 
 
 
314 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  37.17 
 
 
337 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  24.85 
 
 
335 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  23.71 
 
 
339 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  24.4 
 
 
344 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  26.37 
 
 
339 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  23.87 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  23.34 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  24.6 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 
337 aa  97.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  24.94 
 
 
658 aa  97.1  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 
282 aa  96.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 
623 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  26.88 
 
 
407 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  27.2 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  23.74 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  24.73 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.87 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  26.92 
 
 
338 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  23.87 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  24.34 
 
 
355 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  23.87 
 
 
351 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.87 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  22.09 
 
 
362 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  25.45 
 
 
691 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  25.87 
 
 
314 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  24.27 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  23.61 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  32.72 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  24.34 
 
 
600 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.05 
 
 
356 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  23.36 
 
 
330 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  26.98 
 
 
376 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  25.41 
 
 
364 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  27.02 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>