More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1691 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
376 aa  749    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  60.77 
 
 
382 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  46.25 
 
 
401 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  39.66 
 
 
396 aa  226  7e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  42.86 
 
 
407 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  41.23 
 
 
536 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 
397 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
393 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 
385 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  38.02 
 
 
685 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 
387 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.07 
 
 
368 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 
342 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  35.87 
 
 
390 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  38.78 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 
372 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 
397 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  37.34 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 
401 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 
401 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 
456 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  36.13 
 
 
422 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 
588 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.65 
 
 
417 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  32.22 
 
 
415 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 
409 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
413 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 
456 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 
485 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  31.88 
 
 
451 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  32.45 
 
 
418 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.71 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.68 
 
 
344 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 
587 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.07 
 
 
364 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 
364 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.94 
 
 
403 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 
358 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.07 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  29.95 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.78 
 
 
337 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.62 
 
 
345 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  27.02 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  33.11 
 
 
331 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.82 
 
 
341 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  25.06 
 
 
658 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 
363 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.82 
 
 
363 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  29.19 
 
 
345 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  31.18 
 
 
347 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 
352 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 
434 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
372 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 
691 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30.49 
 
 
341 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.55 
 
 
341 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  28.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  28.57 
 
 
356 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.07 
 
 
338 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  25.17 
 
 
333 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 
335 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 
355 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 
407 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 
391 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 
416 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 
623 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 
339 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
327 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  33.09 
 
 
331 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 
339 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 
339 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.49 
 
 
415 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  31.75 
 
 
338 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 
440 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.79 
 
 
340 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 
343 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 
332 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 
331 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  30.61 
 
 
349 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 
339 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 
339 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.21 
 
 
357 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  24.18 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>