More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3030 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 368 aa  727    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  55.34 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  46.79 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  41.44 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  43.09 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  43.09 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  43.46 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  41.06 
 
 		 685 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  43.24 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  39.47 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  40.17 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  39.89 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  44.37 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  43 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  40.51 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  40.26 
 
 		 456 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  42.55 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  39.4 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  35.51 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  40.28 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  40.4 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  35.28 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  36.22 
 
 		 588 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 		 415 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 468 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  33.71 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  33.77 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  33.15 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 587 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  41.41 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.97 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  28.65 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.23 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  28.61 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.05 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.46 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.73 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.53 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.18 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  35.81 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  27.19 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  33.96 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.83 
 
 		 333 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.83 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  33.68 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  28.36 
 
 		 600 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 		 620 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.8 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.93 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  28.76 
 
 		 327 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  26.37 
 
 		 546 aa  119  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.01 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  33.7 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  26.74 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  29.26 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>