More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3212 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 413 aa  834    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  64.67 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  40.51 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  40.74 
 
 		 536 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  40.51 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  39.76 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  38.59 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  37.07 
 
 		 685 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  37.83 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  37.27 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  36.39 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  32.84 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  37.22 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  38.3 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  32.67 
 
 		 368 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  32.11 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.07 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  35.71 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 623 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  30.17 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 588 aa  130  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 344 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.46 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.54 
 
 		 333 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  33.43 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  33.09 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  30.1 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  30.75 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 338 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.33 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  31.64 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  26.61 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.51 
 
 		 341 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  27.01 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  32.29 
 
 		 341 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.62 
 
 		 389 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  32.37 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  32.54 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  30.14 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.14 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  32.51 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.86 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.86 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 691 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 314 aa  114  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  34.18 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  29.58 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  28.13 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  35.04 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  30.63 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.79 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  25.57 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  29.28 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>