More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1692 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 382 aa  760    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  56.99 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  50.33 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  46.79 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  39.33 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  41.82 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 536 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  36.2 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  37.66 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  40.65 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  37.66 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  38.38 
 
 		 685 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  36.9 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  35.48 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  35.28 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 		 588 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  34.06 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  33.42 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  31.95 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.28 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.71 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  31.48 
 
 		 493 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 691 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 587 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  26.76 
 
 		 333 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  27.37 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  27.52 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.99 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.37 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.32 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  26.47 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.68 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  26.68 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  26.68 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 620 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  31.03 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.91 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  25.49 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 623 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  25.08 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.93 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.64 
 
 		 658 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  28.28 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  28.17 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  28.44 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  26.37 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  28.74 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.35 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.12 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.11 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  28.98 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  26.45 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  27.85 
 
 		 344 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  28.75 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  28.67 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>