More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1977 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 418 aa  855    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  51.16 
 
 		 587 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  45.45 
 
 		 415 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  44.55 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  41.31 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  43.36 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  35.34 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  35.92 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  31.9 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.07 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  31.98 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  31.19 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.76 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  30.39 
 
 		 685 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  36.21 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.11 
 
 		 368 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  30.13 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  28.7 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  27.25 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  45.08 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  43.9 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  26.56 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  43.44 
 
 		 332 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  23.7 
 
 		 363 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  26.6 
 
 		 485 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  42.62 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  29.35 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  28.41 
 
 		 395 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.52 
 
 		 357 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 327 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  27.61 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  28.72 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  40.48 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 325 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  41.67 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  40.3 
 
 		 338 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  41.67 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 588 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.45 
 
 		 333 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  40.83 
 
 		 337 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.6 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  39.57 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  41.04 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  33.18 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  35.2 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.89 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  27.34 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  40.65 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 		 623 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  23.62 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  42.15 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  38.93 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  22.94 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  40.29 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.62 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.02 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.62 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  41.46 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.82 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  41.8 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  41.8 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  41.8 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  41.8 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  38.84 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  43.44 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  27.03 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  39.34 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  23.62 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.44 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>