More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 395 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  47.46 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  43.19 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  42.81 
 
 		 536 aa  223  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  39.61 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  41.82 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  41.82 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  39.24 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  38.33 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  38.58 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  36.36 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  44.09 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  38.78 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 588 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  34.08 
 
 		 685 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 		 456 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  33.87 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  33.61 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  33.51 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.97 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  31.41 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  28.5 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  31.11 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  27.15 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.03 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.39 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.56 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  26.83 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.65 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.29 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 587 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  26.56 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  25.9 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  26.29 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  26.56 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  26.5 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  28.04 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.29 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.29 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.06 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 691 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  27.84 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  25.56 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.1 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  28.17 
 
 		 338 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  27.4 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  29.09 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  28.42 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  28.89 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  27.96 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.82 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  28.21 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  25.74 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  26.74 
 
 		 355 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.48 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  27.96 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  24.86 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  29.17 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  28.83 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  29.23 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  45.16 
 
 		 314 aa  94.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  25.73 
 
 		 340 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>