More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4536 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
371 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  60.87 
 
 
415 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  60.87 
 
 
415 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  60.87 
 
 
415 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  61.63 
 
 
415 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  57.59 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  57.14 
 
 
415 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 
409 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  41.18 
 
 
493 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 
587 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 
418 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  40.41 
 
 
434 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 
372 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 
385 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 
387 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 
397 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 
395 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 
368 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
407 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  31.03 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  30.11 
 
 
397 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  28.91 
 
 
456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 
401 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 
413 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 
401 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.22 
 
 
685 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 
376 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  40.35 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  32.25 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  39.66 
 
 
320 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.27 
 
 
403 aa  113  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 
468 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  33.63 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  25.15 
 
 
333 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  27.63 
 
 
393 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 
370 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  24.54 
 
 
333 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  24.1 
 
 
339 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 
588 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 
351 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  25.31 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  27.83 
 
 
407 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  25.08 
 
 
344 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 
282 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  24.38 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  25.58 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  38.1 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  26.5 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  37.7 
 
 
314 aa  97.1  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  27.05 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  45.45 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 
485 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  21.7 
 
 
330 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  25.62 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  24.61 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.35 
 
 
451 aa  89.7  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.52 
 
 
317 aa  89.7  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  24.22 
 
 
364 aa  89.7  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  27.65 
 
 
363 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  42.57 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  27.52 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.1 
 
 
338 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  23.78 
 
 
335 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  41.32 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  23.75 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  41.32 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  27.99 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  24.92 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  43.08 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  25.89 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  26.64 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  25.3 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  43.2 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  37.19 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  39.71 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.3 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>