More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2534 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 339 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  64.79 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  59.02 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  54.19 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  55.91 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  56.09 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  48.18 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  42.37 
 
 		 347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.64 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  36.05 
 
 		 352 aa  178  9e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 348 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  38.04 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  38.81 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  39.45 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  33.11 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  31.53 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  33.1 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  35.79 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  32.62 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.6 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  31.89 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  36.55 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  39.42 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.02 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  32.01 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.77 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.77 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  32.75 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  31.68 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  31.68 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  33.93 
 
 		 414 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.8 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.36 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  32.13 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  30.33 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  40.73 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.24 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  38.3 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  31.31 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  37.27 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.19 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  28.88 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.19 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.67 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.71 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  32.98 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  30.38 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 440 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>