More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1072 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  51.63 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  49.55 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  45.68 
 
 		 352 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  45.05 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  44.1 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  42.64 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  42.62 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  40.52 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  36.61 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.87 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  32.15 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.97 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.54 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.96 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.83 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  30.69 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.92 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 620 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.61 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.1 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  29.05 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  26.37 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  26.69 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  27.8 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  27.8 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  29.35 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  29.77 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  26.8 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  28.36 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  26.59 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  28.05 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  28.39 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  29.35 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  28.43 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  27.39 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  27.78 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  29.6 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  32.09 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  26.23 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  31.62 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 599 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  27.02 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  27.43 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  29.97 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  31.25 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  28.88 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  28.34 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  27.06 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  28.9 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 467 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  28.52 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>