More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3021 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 358 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  62.73 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  57.42 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  50.16 
 
 		 327 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  49.84 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  53.4 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  48.48 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  41.8 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  41.76 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  40.33 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  36.9 
 
 		 351 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  36.89 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  37.15 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 		 326 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.88 
 
 		 579 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  36.97 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  36.18 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  34.8 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.46 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  35.08 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.2 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 336 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 336 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  39.04 
 
 		 438 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  39.04 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  33.91 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  33.91 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.91 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  36.82 
 
 		 599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  35.76 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  37.63 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  32.63 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 		 440 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  33.91 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.91 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  38.16 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  33.62 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  35.43 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  32.04 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  38.06 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.88 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.08 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  35.42 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 333 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.16 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  35.69 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.9 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  34.45 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>