More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5013 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 345 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  56.94 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  51.63 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  44.73 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  45.15 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  41.92 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  46.72 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  43.56 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  39.82 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  40.3 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  34.05 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.4 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.61 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  28.05 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  25.61 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.51 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  28.74 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.29 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  29.04 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  27.22 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  27.21 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 620 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 440 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  28.27 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.61 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  29.74 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  26.49 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  27.98 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  26.11 
 
 		 623 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  27.79 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  27.07 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  28.4 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  24.48 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.56 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  27.53 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  27.58 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.27 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  24.77 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  26.43 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  29.04 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 599 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.73 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.19 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  30.43 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  26.05 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  28.47 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  27.99 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  26.97 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  27.06 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>