More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12763 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 347 aa  715    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  53.47 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  51.03 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 		 348 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  40.62 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  40.52 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  39.94 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  40.3 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  33.53 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  30.35 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.45 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  27.08 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 		 620 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  31.79 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 599 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  28.78 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  29.8 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.08 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  31.93 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.13 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.06 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 363 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  27.35 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  29.51 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.02 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 579 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  29.03 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  28.49 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  30.35 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 440 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  28.91 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 464 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  39.44 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  28.01 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  27.76 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  28.2 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  28.74 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  31.99 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.61 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  30.31 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  28.02 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  27.16 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.61 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.61 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  26.5 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  27.44 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  27.91 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>