More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1765 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 391 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  58.04 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  61.39 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  56.68 
 
 		 438 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  55.75 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  56.4 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  58.82 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  57.57 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  56.25 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  48.24 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  48.83 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  54.25 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  47.16 
 
 		 416 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  47.65 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  45.5 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  46.59 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  49.27 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  46.34 
 
 		 467 aa  328  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  46.34 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  52.06 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  46.59 
 
 		 407 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  47.32 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  48.91 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  44.03 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  44.03 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  51.33 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  47.06 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  44.9 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  46.58 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  39.08 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  39.89 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  38.81 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  40.43 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  45.8 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  37.4 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  51.54 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  37.15 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  42.21 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  37.72 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  41.43 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  39.3 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  39.62 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  38.59 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  38.59 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  38.59 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  38.59 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  39.31 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.13 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  38.33 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.23 
 
 		 333 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 345 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.98 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.83 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.71 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  40.19 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  40.27 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  37.09 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.66 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  37.33 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.78 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  39.01 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  36.06 
 
 		 355 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  37 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  35.51 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  39.86 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 320 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  38.29 
 
 		 316 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  38.69 
 
 		 358 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 327 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>