More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0748 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 399 aa  817    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  68.83 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  69.11 
 
 		 405 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  69.89 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  58.82 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  60.83 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  57.44 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  57.18 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  55.36 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  49.86 
 
 		 467 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  49.86 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  50.13 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  49.86 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  47.9 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  50.99 
 
 		 464 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  51.81 
 
 		 579 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  49.72 
 
 		 454 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  47.62 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  48.91 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  48.39 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  47.84 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  47.95 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  48.6 
 
 		 418 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  53.29 
 
 		 349 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  46.18 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  46.2 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  45.64 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  45.48 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  38.93 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  38.4 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  54.34 
 
 		 392 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  54.34 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  38.46 
 
 		 384 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  42.35 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  51.52 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  44.29 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  39.49 
 
 		 363 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  40.8 
 
 		 325 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  39.17 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.31 
 
 		 341 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  38.42 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  36.66 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 335 aa  212  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.28 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.29 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  37.16 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  38.48 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  37.95 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  40.32 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.22 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  39.61 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  36.39 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  37.62 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.56 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  36.75 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  38.56 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.86 
 
 		 355 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 335 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  36.2 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  43.51 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  34.74 
 
 		 337 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  34.67 
 
 		 349 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  34.37 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.67 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  40.81 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  36.58 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  34.77 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>