More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1578 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 335 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  67.46 
 
 		 335 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  65.37 
 
 		 335 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1981  aminodeoxychorismate lyase  67.76 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643733  hitchhiker  0.0054614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  60.06 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  57.01 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  57.01 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  55.65 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  58.26 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  57.31 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  57.61 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  57.19 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  46.01 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  44.71 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  44.18 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  43.45 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  42.18 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  44.51 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  46.67 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  43.9 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  44.02 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  44.02 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  45.07 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  43.15 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  45.07 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  46.93 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  44.48 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  44.73 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  42.12 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  43.07 
 
 		 343 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  44.44 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  40.42 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  42.43 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  46.51 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  42.28 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  45.82 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  43.37 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  45.24 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  42.76 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  41.92 
 
 		 351 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  41.75 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  42.11 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  41.69 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  41.54 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  40.12 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  43.09 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  40.75 
 
 		 400 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  42.57 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.23 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  42.33 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  41.03 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  47.41 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  39.71 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  43.28 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  40.98 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  46.62 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  39.81 
 
 		 421 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  47.01 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  41.91 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  43.61 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  42.91 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  42.91 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  42.91 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  42.91 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  41.04 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  42.91 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 427 aa  232  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  43.23 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  42.44 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  39.71 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  40.72 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  44.4 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  37.43 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  45.76 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  40.97 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  39.41 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  39.41 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  42.45 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  39.16 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  43.24 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  41.58 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  44.02 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  40.69 
 
 		 370 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  44.79 
 
 		 339 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  41.82 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>