More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1203 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  93.2 
 
 		 412 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 405 aa  833    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  72.94 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  69.87 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  61.58 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  60.77 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  61.05 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  57.3 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  48.93 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  45.97 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  45.97 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  51.25 
 
 		 579 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  46.7 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  46.03 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  46.3 
 
 		 422 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  48.02 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  49.16 
 
 		 599 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  47.37 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  45.33 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  47.12 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  45.66 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  46.43 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  46.3 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  45.11 
 
 		 442 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  45.11 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  45.98 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  50.65 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  45.56 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  44.86 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  41.18 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  38.7 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  39.12 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  50.22 
 
 		 393 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  42.33 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  35.68 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  40.37 
 
 		 312 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  42.16 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  38.99 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  39.1 
 
 		 341 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  38.81 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.58 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  38.17 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  39.34 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  40.69 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  39.34 
 
 		 339 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  36.66 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 343 aa  206  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.4 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.46 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.19 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  35.58 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  36.81 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.71 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.54 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  36.81 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  36.81 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  36.81 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  36.19 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  38.41 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  35.87 
 
 		 335 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  41.61 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  36.01 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.65 
 
 		 328 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.36 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.61 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  32.54 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  35.49 
 
 		 336 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  32.73 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  39.7 
 
 		 326 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.2 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.23 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.07 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>