More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3356 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 349 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  50.71 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  53.07 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  51.95 
 
 		 391 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  53.07 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  52.49 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  52.75 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  51.42 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  50.15 
 
 		 599 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  50.46 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  48.96 
 
 		 416 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  48.96 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  50.79 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  49.54 
 
 		 418 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  52.01 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  54.08 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  54.08 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  48.36 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  50.15 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  53.72 
 
 		 399 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  48.82 
 
 		 412 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  50.16 
 
 		 579 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  53.45 
 
 		 456 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  48.08 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 471 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  49.38 
 
 		 414 aa  302  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  48.55 
 
 		 372 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  55.56 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  40.42 
 
 		 392 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  40.42 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  40.94 
 
 		 384 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  40.5 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  44.74 
 
 		 323 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  36.91 
 
 		 384 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  40.6 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  43.2 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  42.57 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 312 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  39.7 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  42.71 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  41.85 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  37.83 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.8 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  39.86 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38.01 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  41.54 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  39.67 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  38.19 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  36.28 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  38.43 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.82 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.91 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  38.91 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.57 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.13 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  36.39 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  34.88 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  34.88 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  34.88 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.24 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  34.54 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.77 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.23 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  34.54 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  35.53 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  34.21 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.64 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  34.88 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  37.29 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>