More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2903 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 392 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  62.86 
 
 		 393 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  61.46 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  62.5 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  57.74 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  54.31 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  53.39 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  40.5 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  34.75 
 
 		 599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  36.68 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  35.98 
 
 		 407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  35.81 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  35.81 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.47 
 
 		 414 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 		 471 aa  235  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  35.54 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  52.13 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  51.89 
 
 		 456 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  34.21 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  39.23 
 
 		 325 aa  223  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  36.87 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  36.64 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  41.79 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.15 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  49.54 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  49.33 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  45.41 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  50.27 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  34.96 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  52.15 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 345 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 345 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  51.61 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  50.26 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  34.67 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  44.2 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  47.42 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  45.12 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.74 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  34.84 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  48.09 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  32.07 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  34.34 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  51.09 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.38 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  31.22 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  35.09 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  53.01 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  30.95 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  49.44 
 
 		 355 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  48.37 
 
 		 338 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  43.46 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  46.19 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  43.64 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  35.9 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  51.08 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  52.72 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  31.09 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  34.4 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  43.86 
 
 		 349 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  43.86 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  44.54 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>