More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2521 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 372 aa  741    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  49.71 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  51.09 
 
 		 579 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  45.5 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  50.31 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  45.11 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  48.35 
 
 		 467 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  48.35 
 
 		 467 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  48.52 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  47.25 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  49.66 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  51.13 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  43.52 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  49.26 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  47.23 
 
 		 599 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  49.83 
 
 		 399 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  46.35 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  49.85 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  45.6 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  47.81 
 
 		 406 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  46.84 
 
 		 391 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  46.05 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 		 422 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  47.68 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  49.67 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  42.67 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  43.11 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  42.67 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  46.2 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  46.81 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  46.2 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  41.33 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  41.21 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  46.81 
 
 		 312 aa  250  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  46.21 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  39.67 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  44.44 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  53.52 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  43.05 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  37.47 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.87 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  39.19 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  38.23 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  36.86 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  41.11 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  39.46 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.64 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 356 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  36.14 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  41.7 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.85 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  38.41 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.97 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  40.69 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  38.41 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  36.54 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.54 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  39.41 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  39.09 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.45 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  36.42 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.3 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  39.84 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  39.92 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  36.45 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>