More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1529 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 331 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  42.46 
 
 		 442 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  44.78 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  41.03 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  40.6 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  41.77 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  39.51 
 
 		 464 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  41.96 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  40.38 
 
 		 467 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  39.81 
 
 		 467 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 		 579 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  41.08 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  38.08 
 
 		 599 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  40.28 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  37.38 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  39.05 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  39.05 
 
 		 407 aa  205  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  35.24 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  37.82 
 
 		 422 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 416 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 415 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  34.94 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  35.5 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 399 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.57 
 
 		 412 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  35.57 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  36.87 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.37 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  30 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.98 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  37.82 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  37.82 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  35.55 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  34.76 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  38.37 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  43.46 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  37.68 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  37.58 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  33.14 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 384 aa  165  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.43 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  32.83 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  33.23 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 427 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.23 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 345 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  39.07 
 
 		 427 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  37.55 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  35.13 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  35.59 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  42.8 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 343 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  39.4 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  34.92 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.59 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  34.14 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.36 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  39.42 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.68 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  36.55 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  40.6 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  31.89 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  33.55 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 336 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>