More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2514 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 337 aa  695    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  66.47 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  62.24 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  61.28 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  56.25 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  54.46 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  56.54 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.51 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 351 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.05 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  34.8 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  35.27 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  33.13 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.1 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 348 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  33.01 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  36.13 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  36.13 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.27 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.68 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  36.82 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  42.8 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  31.25 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  32.48 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  32.84 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  32.84 
 
 		 356 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.87 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.45 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.84 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  40.18 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 579 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.54 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 464 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.83 
 
 		 471 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.02 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.95 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 		 425 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  35.18 
 
 		 422 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  33.66 
 
 		 412 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.72 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.94 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  37.87 
 
 		 599 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  30.59 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.66 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  35.39 
 
 		 620 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>