More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0315 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 389 aa  797    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  57.4 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  58.54 
 
 		 620 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  48.78 
 
 		 349 aa  326  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  47.95 
 
 		 336 aa  318  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  45.75 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  41.31 
 
 		 357 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.6 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.23 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 344 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  38.14 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  42.81 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  40.06 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  40.06 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.18 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 327 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  35.76 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  37.8 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  36.1 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.31 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  37.3 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  40.06 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  34.67 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  35.92 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.88 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  39.33 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  40.89 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.05 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  39.74 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 		 352 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.92 
 
 		 331 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  37.9 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.42 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.44 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  37.78 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  34.77 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 340 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 335 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  31.51 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  59.84 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  32.08 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  36.8 
 
 		 335 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.35 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 326 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>