More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0204 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
314 aa  634    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 
330 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 
344 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.3 
 
 
356 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 
357 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 
376 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  37.02 
 
 
326 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 
351 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.85 
 
 
340 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  39.61 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  42.74 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  42.74 
 
 
333 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  31.9 
 
 
331 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 
344 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 
362 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 
336 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
339 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 
337 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  35.66 
 
 
331 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 
347 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 
333 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 
338 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 
327 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  33.58 
 
 
315 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  32.98 
 
 
332 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 
339 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 
339 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 
339 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 
335 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 
337 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 
352 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 
340 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 
370 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 
336 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 
339 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  34.52 
 
 
377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  35.25 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 
349 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  34.17 
 
 
345 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 
339 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
336 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 
339 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  32.85 
 
 
328 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 
339 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  35.36 
 
 
331 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  33.57 
 
 
343 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  32.96 
 
 
340 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  29.43 
 
 
339 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  35.42 
 
 
363 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 
335 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  33.47 
 
 
356 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 
343 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  32.72 
 
 
343 aa  149  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.68 
 
 
345 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
416 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 
456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  32.19 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.81 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.47 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  28.94 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  35.19 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  37.6 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 
464 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  30.8 
 
 
341 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  39.91 
 
 
373 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.71 
 
 
349 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 
422 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  39.2 
 
 
338 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 
399 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 
620 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 
579 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 
345 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 
341 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 
337 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 
467 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 
467 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
323 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 
333 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
425 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  37.01 
 
 
370 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.45 
 
 
337 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>