More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1231 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
343 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  96.5 
 
 
343 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  96.21 
 
 
343 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  75 
 
 
338 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  43.03 
 
 
357 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  40.46 
 
 
344 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  40.18 
 
 
326 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 
440 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  39.7 
 
 
340 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  37.54 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 
333 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.95 
 
 
376 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  40.82 
 
 
331 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  42.19 
 
 
333 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 
358 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  38.26 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
336 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
336 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  40.06 
 
 
338 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 
332 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.13 
 
 
336 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  37.74 
 
 
345 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  38.68 
 
 
345 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  38.68 
 
 
345 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  38.68 
 
 
345 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 
349 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  38.82 
 
 
358 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  38.36 
 
 
345 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.71 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.76 
 
 
414 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  40.67 
 
 
620 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  38.97 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.99 
 
 
345 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  38.62 
 
 
324 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.34 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.54 
 
 
363 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 
362 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.33 
 
 
351 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 
339 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 
332 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 
339 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 
352 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 
339 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 
355 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  39.86 
 
 
327 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 
372 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  43.35 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  36.6 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.11 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  39.4 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.67 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  39.4 
 
 
412 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  36.17 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  39.34 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 
421 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  39.86 
 
 
340 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.93 
 
 
339 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  37.75 
 
 
349 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.82 
 
 
379 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 
362 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 
344 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 
325 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  40.13 
 
 
377 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 
335 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 
334 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  37.21 
 
 
456 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 
344 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  40.4 
 
 
339 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 
351 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 
393 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.21 
 
 
349 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 
314 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  36.3 
 
 
337 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 
467 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.62 
 
 
363 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.47 
 
 
340 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  33.62 
 
 
341 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  33.53 
 
 
406 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
418 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 
467 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  40.48 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  40.48 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>