More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4657 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 362 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  38.14 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  35.41 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 620 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.04 
 
 		 440 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  33.8 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  32.66 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.63 
 
 		 335 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  35.95 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 326 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.64 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 335 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 579 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 467 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  31.74 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.36 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  32.54 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  29.91 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  33.51 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  31.83 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 342 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.18 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  31.88 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  31.52 
 
 		 425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.73 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  32.6 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  31.71 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.98 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.15 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  26.76 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  27.81 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  27.68 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.95 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 454 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.19 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.19 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.19 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.19 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  32.39 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  31.13 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  31.51 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  31.73 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>