More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0650 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  100 
 
 		 356 aa  721    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  44.59 
 
 		 376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  45.96 
 
 		 357 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  44.76 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  43.34 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  41.31 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  40.83 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  43 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  40.19 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  40.85 
 
 		 440 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  41.8 
 
 		 620 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  40.38 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  40.56 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  38.76 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.14 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  41.06 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  39.6 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  40.33 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.72 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 314 aa  199  9e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  42.23 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  38.39 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  38.06 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  38.56 
 
 		 377 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.67 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  37.96 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.02 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.13 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.25 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 579 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  37.75 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 		 599 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 492 aa  185  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.78 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.78 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.87 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  32.85 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 		 456 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  38.77 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  34.14 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.76 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  38.54 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  35.64 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  40.34 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  35.64 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  38.21 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  36.95 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  38.34 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.36 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.92 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 343 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>