More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1129 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 336 aa  693    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  51.82 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  49.54 
 
 		 389 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 620 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  48.64 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  46.18 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  43.41 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  43 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  40.35 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 		 338 aa  205  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  39.57 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.87 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  42.16 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  38.9 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  41.41 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  39.61 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  39.87 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.76 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.82 
 
 		 377 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.37 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.83 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  38.14 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.78 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  41.03 
 
 		 357 aa  185  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  38.32 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  35.01 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  39.6 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  39.03 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.19 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  38.54 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  37.28 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  39.15 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 		 345 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  36.05 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  38.44 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.84 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  38.44 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  33.53 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  40.64 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  37.38 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.98 
 
 		 341 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  36.98 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 456 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  39.17 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  36.95 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  37.09 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  36.26 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.94 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  39.6 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  39.74 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  33.54 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  37.71 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.5 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>