More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1090 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 331 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  59.38 
 
 		 340 aa  348  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  54.32 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  54.84 
 
 		 358 aa  331  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  53.8 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  48.46 
 
 		 333 aa  301  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  49.53 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.19 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  43.96 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  41.48 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  41.81 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  40.18 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.03 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  38.28 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  41.95 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.31 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  34.59 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  41.61 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  41.95 
 
 		 343 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 620 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  36.3 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.61 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  38.7 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  36.95 
 
 		 362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.14 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  39.32 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  39.06 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 338 aa  182  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  40.28 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  35.84 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.02 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  34.37 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  36.81 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  39.04 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  35.31 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  41.28 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  38.7 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  36.64 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  35.55 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.57 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  37.37 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  37.37 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  30.41 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  37.04 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.82 
 
 		 579 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  30.41 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  37.37 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  37.37 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  37.37 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.61 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 442 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.41 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  36.54 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  37.16 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  37.76 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.41 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 492 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.12 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.39 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>