More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2733 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 337 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  66.47 
 
 		 337 aa  471  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  62.92 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  60.6 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  58.81 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  55.52 
 
 		 349 aa  358  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  58.02 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.54 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.31 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  34.11 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  36.23 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  32.53 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.08 
 
 		 414 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  33.89 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  33.89 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.41 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  32.72 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 399 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 471 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  33.57 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  42.69 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  33.88 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  33.11 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 467 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 467 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  29.94 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  31.55 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.46 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  31.87 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.74 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  34.23 
 
 		 363 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 456 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  31.23 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.6 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 620 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.5 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  32.46 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.9 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.72 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  35.83 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.11 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  34.77 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.15 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  31.37 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  32.67 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  34.77 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>