More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0225 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
322 aa  642    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  65.84 
 
 
353 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  48.43 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.65 
 
 
327 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.14 
 
 
351 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 
339 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 
341 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  32.36 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.77 
 
 
333 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 
355 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 
351 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  34.24 
 
 
340 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 
344 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 
362 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 
358 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
337 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 
370 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.53 
 
 
327 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.1 
 
 
356 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  36.63 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 
339 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 
376 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 
391 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.16 
 
 
345 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.48 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 
337 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 
464 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 
405 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  37.08 
 
 
385 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 
407 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 
326 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.9 
 
 
356 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  31.34 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.41 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
442 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.19 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.9 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
342 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.14 
 
 
356 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.89 
 
 
340 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 
349 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 
456 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 
363 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.14 
 
 
351 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 
416 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.55 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 
454 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.53 
 
 
337 aa  136  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 
467 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 
467 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  30.32 
 
 
399 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  30.09 
 
 
406 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 
536 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 
331 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.53 
 
 
425 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 
412 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  30.7 
 
 
377 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  29.67 
 
 
415 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 
418 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.01 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.78 
 
 
685 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  31.39 
 
 
438 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.69 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.42 
 
 
658 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  31.39 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.04 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 
343 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 
334 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 
343 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 
368 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  27.11 
 
 
600 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 
328 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 
340 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>