More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3156 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 536 aa  1053    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  47.6 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  55.34 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  46.84 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  44.25 
 
 		 372 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  47.8 
 
 		 387 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  43.16 
 
 		 342 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  43.83 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  40.46 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  41.54 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  39.66 
 
 		 685 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  42.81 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  41.21 
 
 		 395 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  41.19 
 
 		 397 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  39.22 
 
 		 368 aa  207  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  39.59 
 
 		 376 aa  205  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 		 456 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 382 aa  200  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  42.17 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 401 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  39.17 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 		 409 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  36.8 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  44.86 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 393 aa  183  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  37.15 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 588 aa  174  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  45.18 
 
 		 320 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.55 
 
 		 417 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  33.61 
 
 		 396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  36.93 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.9 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  30.62 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  30.62 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  30.4 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.62 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.62 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 347 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.43 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.34 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 322 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  35.77 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.21 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.71 
 
 		 389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.78 
 
 		 356 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  29.58 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 658 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 		 341 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 349 aa  130  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  30.31 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.65 
 
 		 355 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  31.21 
 
 		 340 aa  127  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 		 331 aa  126  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 620 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 338 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  33.56 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  31.19 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.63 
 
 		 333 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 337 aa  124  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.03 
 
 		 339 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  34.76 
 
 		 353 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 363 aa  123  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 344 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 337 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.48 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 314 aa  120  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  32.76 
 
 		 328 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 351 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 371 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  35.64 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 352 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 349 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 		 351 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 335 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  40.72 
 
 		 259 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 336 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  34.22 
 
 		 331 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>