More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1349 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 397 aa  817    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  48.81 
 
 		 395 aa  292  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  41.28 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.72 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  42.3 
 
 		 536 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  38.17 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  41.83 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  39.42 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43.31 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  38.56 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  36.54 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  36.97 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  38.22 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  34.65 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.59 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.14 
 
 		 685 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  33.06 
 
 		 422 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.9 
 
 		 588 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  31.19 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  29.31 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 587 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  28.98 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  25.93 
 
 		 658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.75 
 
 		 320 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 464 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  28.24 
 
 		 335 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  29.84 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.17 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  26.88 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  28.66 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 340 aa  106  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  28.24 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 691 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  27.63 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.46 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  26.55 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  28.52 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  28.25 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  28.06 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  28.95 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  31.39 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  28.72 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  37.56 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.82 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.31 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  29.72 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  29.93 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  27.66 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>