More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 493 aa  986    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  48.26 
 
 		 409 aa  353  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  42.65 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  40.75 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  39.42 
 
 		 417 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  41.99 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  35.34 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  36.6 
 
 		 536 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.65 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 342 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.41 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.37 
 
 		 395 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 401 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.1 
 
 		 358 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  30.73 
 
 		 588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  33.81 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  33.6 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  29.45 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  28.31 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 368 aa  121  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  30.6 
 
 		 685 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.26 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  30.61 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  31.18 
 
 		 393 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  29.67 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  28.68 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 351 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  27.17 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 382 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  37.71 
 
 		 331 aa  106  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.87 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.98 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.83 
 
 		 389 aa  103  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  35.88 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  25.26 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  25.13 
 
 		 658 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  38.76 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  26.49 
 
 		 330 aa  100  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  36.87 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.86 
 
 		 317 aa  98.6  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  30.03 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  29.28 
 
 		 340 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  39.77 
 
 		 332 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.48 
 
 		 338 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  39.29 
 
 		 334 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  39.07 
 
 		 316 aa  96.3  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 335 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  41.62 
 
 		 333 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  37.72 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 		 333 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  30.47 
 
 		 312 aa  94.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  31.46 
 
 		 332 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  27.49 
 
 		 335 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 346 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  26.11 
 
 		 407 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 337 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 339 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 339 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  40.3 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 352 aa  93.2  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 		 339 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  34.13 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 339 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  27.27 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 339 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  36.63 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  36.87 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.69 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.96 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  33.53 
 
 		 300 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  33.53 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>