More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1886 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  646    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  79.94 
 
 		 314 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  60.76 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  56 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.67 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  54.72 
 
 		 362 aa  345  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  55.37 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  53.72 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  52.31 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  47.56 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.5 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  34.18 
 
 		 399 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  39.15 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 471 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  37.08 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  29.23 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  33.62 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 464 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.9 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  36.41 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  39.01 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  35.86 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.29 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 467 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  36.31 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.21 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  33.05 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  35.75 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  32.49 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  31.52 
 
 		 454 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 415 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  37.02 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  34.54 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 		 384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  37.64 
 
 		 418 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  37.78 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  39.88 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  35.39 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.95 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  30.32 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  30.32 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  37.64 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  39.78 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 599 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.64 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  45.74 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 536 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  32.03 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.91 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 357 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  36.42 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 434 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  34.27 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  37.22 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  35.63 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  29.79 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  38.2 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  33.6 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  36 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  36.27 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  38.64 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  34.92 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.48 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  34.16 
 
 		 392 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 456 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>