More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0900 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 338 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  49.52 
 
 		 345 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  46.77 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  41.77 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  41.07 
 
 		 352 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  43.54 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  41.35 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  41.11 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  38.78 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.5 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.5 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.5 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  38.5 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  38.5 
 
 		 356 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  38.5 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  38.92 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.65 
 
 		 340 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 424 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  36.56 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 344 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.52 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  35.98 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  36.81 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.69 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  35.85 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.21 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.92 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 326 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  34.34 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 456 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.72 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.04 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.33 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  32.43 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  39.18 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  35.02 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  35.02 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  33.11 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  35.67 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.31 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  34.65 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.86 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  35.25 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.55 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  32.77 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 658 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 451 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 440 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  35.41 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  35.23 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  34.67 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  35.74 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  33.22 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  32.25 
 
 		 412 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 471 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>