More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4376 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
362 aa  744    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  55.52 
 
 
351 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 
345 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 
352 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 
338 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 
355 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 
341 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 
344 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.37 
 
 
339 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.97 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  36.51 
 
 
335 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 
358 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.06 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  35.08 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.64 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  33.71 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 
357 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 
351 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 
337 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.54 
 
 
403 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 
331 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 
333 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.93 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  36.71 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 
362 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 
327 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 
351 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 
336 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  30.77 
 
 
600 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.32 
 
 
363 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 
364 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 
345 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 
345 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
492 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 
345 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.04 
 
 
343 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  33.15 
 
 
363 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 
345 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 
363 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
456 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.44 
 
 
356 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 
425 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  34.98 
 
 
412 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 
339 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  34.98 
 
 
438 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 
356 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 
412 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 
442 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 
335 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 
356 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.22 
 
 
379 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
393 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 
415 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  30.64 
 
 
346 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
336 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
336 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 
338 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  31.31 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.16 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  36.63 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  31.91 
 
 
332 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  35.89 
 
 
399 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.88 
 
 
356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 
440 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.98 
 
 
340 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 
339 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 
620 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
329 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  31.64 
 
 
356 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.42 
 
 
351 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 
400 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 
405 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  33.11 
 
 
406 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.05 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
343 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  39.44 
 
 
353 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
406 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
335 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.88 
 
 
356 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 
422 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.44 
 
 
371 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 
454 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
345 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.78 
 
 
326 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 
345 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  30.66 
 
 
333 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  33.44 
 
 
358 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  30.27 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  32.19 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.55 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.45 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>