More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3559 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
341 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 
352 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  42.63 
 
 
351 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  44.9 
 
 
344 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 
355 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  37.05 
 
 
345 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.63 
 
 
351 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
424 aa  205  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 
345 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  35.54 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  41.38 
 
 
335 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  36.9 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 
347 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 
357 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 
363 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 
362 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
364 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  36.14 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
370 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 
364 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  30.28 
 
 
356 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 
322 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.34 
 
 
333 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  33.8 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.68 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.34 
 
 
333 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  35.47 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2626  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 
316 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.1 
 
 
327 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 
362 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 
336 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 
326 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 
335 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
347 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 
331 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
349 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
360 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.83 
 
 
351 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.46 
 
 
356 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.87 
 
 
337 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  32.55 
 
 
356 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
353 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  32.75 
 
 
356 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
356 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  33.92 
 
 
414 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.55 
 
 
356 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 
339 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 
362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 
356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 
391 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 
599 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  43.75 
 
 
349 aa  153  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 
356 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.75 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 
403 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 
348 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 
369 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 
328 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.86 
 
 
340 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  32.25 
 
 
315 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 
357 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  34.75 
 
 
336 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 
456 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 
340 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 
332 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 
336 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 
579 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  29.11 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  31.66 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 
399 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 
345 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 
356 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 
412 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.87 
 
 
389 aa  145  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 
314 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.78 
 
 
403 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 
337 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  31.47 
 
 
464 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 
339 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 
425 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 
546 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 
336 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 
405 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 
467 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.07 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>