More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0659 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 546 aa  1106    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  50.51 
 
 		 658 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 364 aa  269  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.89 
 
 		 356 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.89 
 
 		 356 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  37.63 
 
 		 356 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  37.89 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 356 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.37 
 
 		 356 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 356 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  37.93 
 
 		 351 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 355 aa  228  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 363 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  38.63 
 
 		 259 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 345 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  29.04 
 
 		 357 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28.95 
 
 		 345 aa  153  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 339 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 355 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.63 
 
 		 389 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 352 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.04 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 362 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.02 
 
 		 403 aa  143  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 327 aa  141  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 335 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  28.11 
 
 		 353 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  28.5 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  28.81 
 
 		 337 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 351 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  24.69 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  27.55 
 
 		 326 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  28.15 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.33 
 
 		 333 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.08 
 
 		 416 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 338 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.06 
 
 		 333 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  26.94 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  27.79 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  29.94 
 
 		 340 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  26.89 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  27.23 
 
 		 418 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  27.42 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 349 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.08 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  28.13 
 
 		 331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  28.24 
 
 		 360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  27.35 
 
 		 344 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  27.65 
 
 		 363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  29.94 
 
 		 349 aa  120  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  27.11 
 
 		 368 aa  120  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 403 aa  120  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  27.49 
 
 		 406 aa  120  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  27.73 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  26.3 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  26.13 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  26.49 
 
 		 339 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  26.1 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  27 
 
 		 349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  25.57 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  26.49 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  28.26 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 337 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  26.2 
 
 		 376 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 		 335 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  27.41 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  27.63 
 
 		 339 aa  116  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  24.32 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 339 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  25.41 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  25.54 
 
 		 332 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  25.67 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>