More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2122 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
340 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  64.31 
 
 
337 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  61.28 
 
 
337 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  63.75 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  59.63 
 
 
336 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  58.82 
 
 
349 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  60.39 
 
 
339 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  43.1 
 
 
347 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  35.41 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 
344 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  41.46 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  42.18 
 
 
357 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.91 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 
327 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  39.18 
 
 
370 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  35.65 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 
333 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 
352 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 
339 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  36.6 
 
 
345 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.07 
 
 
351 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 
336 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 
358 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 
347 aa  169  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
338 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 
362 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 
338 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.06 
 
 
440 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 
345 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.57 
 
 
335 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
344 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 
348 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  30.88 
 
 
352 aa  166  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  39 
 
 
414 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.9 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  33.44 
 
 
337 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 
331 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 
620 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.62 
 
 
403 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.77 
 
 
339 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  38.96 
 
 
344 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 
337 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.12 
 
 
342 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.62 
 
 
412 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 
363 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  35.62 
 
 
438 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 
364 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 
335 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33.23 
 
 
338 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.69 
 
 
338 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  33.02 
 
 
337 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 
349 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 
339 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  34.54 
 
 
340 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  39.61 
 
 
331 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.5 
 
 
363 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  33.66 
 
 
338 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  42.61 
 
 
326 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.11 
 
 
362 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 
314 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  35.62 
 
 
333 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 
341 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.22 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  31.6 
 
 
343 aa  153  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 
389 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 
372 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.4 
 
 
332 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.9 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  41.74 
 
 
331 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.69 
 
 
333 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  35.83 
 
 
399 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.8 
 
 
339 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  37.22 
 
 
340 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
336 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 
344 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 
315 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  35.41 
 
 
579 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 
341 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  37.22 
 
 
340 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.05 
 
 
355 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  37.22 
 
 
340 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  37.22 
 
 
340 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  37.22 
 
 
340 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 
343 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
442 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 
341 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
345 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.29 
 
 
333 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
345 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
345 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 
373 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 
372 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
345 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.48 
 
 
312 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 
405 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>