More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1845 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 348 aa  715    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  44.83 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  43.54 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  42.98 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  44.1 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  41.94 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  40.95 
 
 		 364 aa  269  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  41.57 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  44.51 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  40.7 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  36.42 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.85 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  28.07 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  29.67 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.87 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  29.29 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  30.43 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  41.04 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  26.09 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  34.16 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  28.96 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  34.16 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  27.62 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  26.87 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  27.51 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  28.21 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.93 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  27.3 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  26.1 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 620 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  26.84 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  27.06 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  27.22 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.21 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  25.38 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  26.85 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  30.21 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  26.13 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  31.92 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  39.53 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  26.99 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 579 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  26.15 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  27.94 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  26.77 
 
 		 442 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  28.9 
 
 		 599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  26.96 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  29.39 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  27.5 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  25.6 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  27.84 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  27.68 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  39.64 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  26.47 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  26.62 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.46 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  26.78 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  26.17 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  27.36 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  29.74 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  27.67 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 407 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>